桂附理中丸和附子理中丸的主要区别在于药材的组成及适应症。

1. 药材组成不同：桂附理中丸的主要成分包括桂枝、附子、干姜、人参、白术、炙甘草等；而附子理中丸则以附子、干姜、人参、白术、炙甘草为主，去除了桂枝。

2. 作用机理差异：桂附理中丸主要用于温中散寒，理气止痛，增强脾胃功能，适用于脾胃虚寒引起的腹痛、腹泻、呕吐等症状。附子理中丸则偏重于补阳温中，祛寒止痛，适用于阳虚寒凝所致的脘腹冷痛、腹泻等。

3. 适应症不同：桂附理中丸适用于脾胃虚寒引起的症状，如食欲不振、便溏等；而附子理中丸更侧重于治疗寒湿侵袭、阳虚引起的腹痛、泄泻等。

综上，桂附理中丸偏重于温阳、散寒、理气，而附子理中丸则更注重温阳、祛寒、补气。